وقد تم اقتراح عدد من النظريات فيما يتعلق بمذهبه (مدرسة الفكر في الفقه الإسلامي). اعتبر المؤرخ في العصور الوسطى ظهير الدين البيهقي (المتوفى 1169) أن ابن سينا من أتباع إخوان الصفا. من ناحية أخرى، أظهر ديميتري جوتاس مع عائشة خان وجول جانسن سنس أن ابن سينا كان حنفي سني. ومع ذلك، أكد فقيه نور الله شوشتاري في القرن الرابع عشر وفقًا لسيد حسين نصر، أنه كان على الأرجح شيعيًا اثني عشري. على عكس ذلك، يعتقد شرف خراساني، مستشهداً برفض الحاكم السني سلطان محمود غضانوي من قِبل ابن سينا إلى بلاطه، أن ابن سينا كان إسماعيليًا. توجد خلافات مماثلة على خلفية عائلة ابن سينا، في حين أن بعض الكتاب اعتبروهم سنيين،